Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms