Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ext2P70428 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms