Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx1P70314 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms