Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp3P70281 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms