Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra8P70278 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms