Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NficP70255 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NficP70255 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NficP70255 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NficP70255 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NficP70255 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NficP70255 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NficP70255 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NficP70255 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NficP70255 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms