Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd13P70217 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms