Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms