Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubb4bP68372 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4bP68372 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms