Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tra2bP62996 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms