Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms