Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckbrP56481 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckbrP56481 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckbrP56481 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckbrP56481 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms