Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dbx1P52950 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms