Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fgd1P52734 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fgd1P52734 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms