Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms