Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec1P51908 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms