Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa8P50706 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms