Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpdP49429 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpdP49429 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpdP49429 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HpdP49429 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HpdP49429 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HpdP49429 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms