Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnrnpa1P49312 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnrnpa1P49312 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms