Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms