Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pax9P47242 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pax9P47242 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms