Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf1P46099 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms