Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms