Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk3P41971 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms