Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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