Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ThpoP40226 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms