Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd1P40201 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd1P40201 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms