Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fen1P39749 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fen1P39749 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms