Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf1P39428 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf1P39428 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms