Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh15P33146 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms