Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BgnP28653 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms