Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa3P28310 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa3P28310 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms