Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gjb3P28231 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms