Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BrafP28028 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BrafP28028 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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