Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms