Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnd1P25322 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms