Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms