Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms