Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ggta1P23336 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms