Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a1P19437 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms