Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms