Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pou4f1P17208 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms