Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms