Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms