Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtcP11725 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtcP11725 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtcP11725 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtcP11725 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtcP11725 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtcP11725 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtcP11725 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtcP11725 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OtcP11725 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms