Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa1P11477 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms