Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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