Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprcP06800 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprcP06800 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprcP06800 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtprcP06800 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PtprcP06800 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcP06800 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms