Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt10P02535 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt10P02535 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms