Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01679 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01679 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01679 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01679 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01679 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01679 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01679 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01679 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01679 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01679 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01679 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms